Если я куплю один из контроллеров, которые указал Sladky, и будут подключать диски к нему, а не к дефолтному, это ограничение 6 каналов никак я не почувствую, верно?
Все верно.
Что делать в случае отказа контроллера?
Коллеги выше уже ответили. У нас был случай замены контроллера на EMC VNX5200, после замены контроллера никаких дополнительных действий не потребовалось, просто их снова стало два.